използвайки специфични лекарства, рибозомното профилиране може да разкрие или иницииращи региони на мРНК, или удължаващи региони. Иницииращите региони могат да бъдат открити чрез добавяне на харингтонин или лактидомицин, за да се предотврати всяко иницииране. Това позволява да се анализира началният кодон на мРНК в целия клетъчен лизат, който се използва за определяне на не-AUG последователности, които инициират транслация. Другите удължаващи се региони могат да бъдат открити чрез добавяне на антибиотици като циклохексимид, които инхибират транслокацията, chloramphenicol който инхибира прехвърлянето на пептиди в рибозомата или нелекарствени средства като термично замразяване. Тези методи за замразяване на удължение позволяват да се анализира кинетиката на превода. Тъй като множество рибозоми могат да превеждат една молекула на мРНК, за да ускорят транслационното действие, RiboSeq демонстрира протеиновите кодиращи региони в иРНК и колко бързо това се прави в зависимост от секвенираната иРНК. Това освен това дава възможност за профилиране на рибозоми, за да се показват сайтове за пауза в транскриптама при специфични кодони. Тези места на бавен или паузиран превод се демонстрират от увеличаване на плътността на рибозомата и тези паузи могат да свързват специфични протеини с техните роли в клетката.
Изображение 251A | Ribosome Профилиране накратко | DennisPietras / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:RibosomeProfilejpg.jpg) from Wikimedia Commons
Автор : Yavor Mendel
Коментари
Публикуване на коментар