DNA последователности, свързани с определен протеин, могат да бъдат изолирани чрез имунопреципитиране на този протеин (ChIP), тези фрагменти могат след това да бъдат хибридизирани до microarray (като масив с плочки), позволяващ определянето на заемането на протеиновия свързващ сайт в целия геном. Примерният протеин до имунопреципитат са модификации на histone (H3K27me3, H3K4me2, H3K9me3 и др.), Протеин от поликомбната група (PRC2: Suz12, PRC1: YY1) и протеин от групата на триторакса (Ash1) за изследване на епигенетичния пейзаж или RNA Полимераза II за изучаване на копиращия пейзаж.
DamID 2а2
аналогично на ChIP, геномните региони, свързани с протеин от интерес, могат да бъдат изолирани и използвани за изследване на microarray за определяне на заемането на мястото на свързване. За разлика от ChIP, DamID не изисква антитела, но използва адениновото метилиране в близост до местата на свързване на протеина, за да селективно амплифицира тези региони, въведени чрез експресиране на минимални количества белтъчини от интерес, слети с бактериална DNA аденин метилтрансфераза.
Изображение 146А | Два чипа Affymetrix. Съответствие е показано вляво вляво за сравнение на размера. | Не е предоставен машинно четим автор. Schutz предположи (въз основа на претенции за авторски права). / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Affymetrix-microarray.jpg) от Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Коментари
Публикуване на коментар