мащабното секвениране често цели секвениране на много дълги парчета DNA, както е показано от цели хромозоми, въпреки мащабното секвениране може по подобен начин да се използва за генериране на много голям брой къси последователности, както е показано в phage display. За по-дълги мишени, както е показано от хромозоми, общият подход се състои в изрязване (с ограничаващи ензими) или срязване (с механични сили) големи DNA фрагменти на по-къси DNA фрагменти. Фрагментираният DNA може след това да бъде клониран в DNA вектор и да се амплифицира в бактериален гостоприемник, както е показано от Escherichia coli. Къса DNA фрагментите, пречистени от отделни бактериални колонии, са индикативно секвенирани и сглобени по електронен път в едно дълго, непрекъснато свързване. Проучванията показват, че добавянето на стъпка за избор на размер за събиране на DNA фрагменти с еднакъв размер може да подобри ефикасността на последователността и точността на сглобяването на генома. В тези проучвания автоматизираното оразмеряване се оказа по-възпроизводимо и прецизно от ръчното оразмеряване на гел.
Изображение 149A | Пример за резултатите от автоматизирано секвениране на вериги DNA. | Abizar в английската Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) от Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Коментари
Публикуване на коментар