най-общо казано, за типичен експеримент за РНК-секвениране в насипни клетки (RNA-seq) се генерират десет милиона анализа и се счита за експресиран ген с по-висок от прага от 50 анализа на kb на милион анализи (RPKM). За ген, който е дълъг 1kb, това отговаря на 500 анализа и минимален коефициент на вариация (CV) от 4% при предположението за разпределението на Poisson. За типична клетка на бозайници, съдържаща 200 000 мРНК, данните за секвениране от поне 50 единични клетки трябва да бъдат обединени в регулация, за да се постигне тази минимална стойност на CV. Въпреки това, поради ефикасността на обратното копиране и друг шум, въведен в експериментите, са необходими повече клетки за точна форма на анализи на експресията и идентификация на типа клетки.
едноклетъчни DNA 2а2 шаблон верига секвениране
едноклетъчни DNA 2а2 шаблон верига на последователността, или нишка-сл, е техника за селективно последователност на родителски шаблон нишки дъщерна клетка. Тази техника има много приложения, включително идентифициране на сестрински хроматидни обмени в родителската клетка преди сегрегацията, идентифициране на неправилно ориентирани контиги по време на привеждане в съответствие на анализите към референтния геном и оценка на неслучайна сегрегация на сестрински хроматиди.
Изображение 261A | Едноклетъчни RNA 2а2 секвениране поток | Yijyechern / Attribution-Share Alike 3.0 Unported | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:RNA-Seq_workflow-5.pdf) from Wikimedia Commons
Автор : Yavor Mendel
Коментари
Публикуване на коментар