разлика между snRNA-seq и scRNA-seq

SnRNA-seq използва изолирани ядра, а не цели клетки, за да профилира генната форма на експресия. Тоест, scRNA-seq измерва както цитоплазмените, така и ядрените стенограми, от друга страна snRNA-seq естествено измерва ядрените snRNA-seq стенописи (макар че някои транскрипти потентността са прикрепени към грубата ендоплазмена reticulum и частично запазени в ядрени преписи). Това позволява snRNA-seq да протича само ядрото, а не цялата клетка. Поради тази причина, в сравнение с scRNA-seq, snRNA-Seq е по-подходяща за профилиране на генна форма на експресия в клетки, които са трудни за изолиране (напр. Адипоцити, неврони), в допълнение като запазени тъкани.

освен това нужните ядра за snRNA-seq могат да бъдат получени бързо и лесно от свежи, леко фиксирани или замразени тъкани, докато изолирането на единични клетки за едноклетъчна RNA-seq( scRNA-seq) включва продължителни инкубации и обработка. Това дава на изследователите умението да получат транскриптоми, които не са толкова смутени по време на изолация.

Изображение 271А | Основните експерименти на snRNA-Seq, които не използват работен поток DroNC-Seq, следва протокол, подобен на този | Simkrai / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Basic_snRNA-Seq_Workflow.png) from Wikimedia Commons

Автор : Yavor Mendel

Препратки:

Техники на молекулярна биология II

Техники на молекулярната биология VI