комбинираното изследване за ограничаване на DNA бисулфит (или COBRA) е техника на молекулярна биология, която позволява чувствителното количествено определяне на нивата на DNA метилиране при специфично геномно locus на конкатенация DNA в малка проба от геном DNA. Техниката е разновидност на бисулфитното секвениране и комбинира бисулфитна конверсия на базата на полимеразна верижна реакция с ограничаване на храносмилането. Първоначално разработена за надеждно боравене с минимални количества геномни DNA от тъканни проби, вградени в парафин, тъканта е била широко използвана в проучвания за рак и епигенетични изследвания.
процедура
лечение с бисулфит
геномна DNA 2а2 интерес се обработва с натриев бисулфит, която въвежда метилиране зависим конкатенация различия. По време на лечението с натриев бисулфит, неметилираните цитозинови остатъци се превръщат в урацил, докато метилираните цитозинови остатъци не се влияят.
Изображение 137A | Първите стъпки на COBRA и молекулните промени, причинени от всяка стъпка до метилирани и неметилирани CpG сайтове. | Jujubix / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cobra_workflow.svg) от Wikimedia Commons
Автор : Milos Pawlowski
Коментари
Публикуване на коментар